Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1O95476 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms