Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB11O95342 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms