Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAF4O95104 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms