Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGR5O75473 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGR5O75473 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGR5O75473 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGR5O75473 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGR5O75473 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGR5O75473 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGR5O75473 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGR5O75473 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGR5O75473 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGR5O75473 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGR5O75473 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGR5O75473 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGR5O75473 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LGR5O75473 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGR5O75473 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGR5O75473 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGR5O75473 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGR5O75473 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGR5O75473 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGR5O75473 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LGR5O75473 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LGR5O75473 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LGR5O75473 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LGR5O75473 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LGR5O75473 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGR5O75473 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGR5O75473 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGR5O75473 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGR5O75473 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGR5O75473 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGR5O75473 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGR5O75473 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGR5O75473 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGR5O75473 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LGR5O75473 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGR5O75473 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGR5O75473 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms