Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC45O75419 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC45O75419 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC45O75419 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC45O75419 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC45O75419 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC45O75419 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC45O75419 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC45O75419 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC45O75419 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC45O75419 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC45O75419 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC45O75419 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC45O75419 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC45O75419 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC45O75419 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC45O75419 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC45O75419 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC45O75419 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC45O75419 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC45O75419 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC45O75419 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC45O75419 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC45O75419 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC45O75419 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC45O75419 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC45O75419 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC45O75419 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC45O75419 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC45O75419 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC45O75419 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC45O75419 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC45O75419 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC45O75419 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC45O75419 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC45O75419 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC45O75419 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC45O75419 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC45O75419 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC45O75419 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC45O75419 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC45O75419 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC45O75419 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC45O75419 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC45O75419 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC45O75419 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC45O75419 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC45O75419 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC45O75419 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC45O75419 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC45O75419 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC45O75419 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC45O75419 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC45O75419 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC45O75419 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC45O75419 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms