Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KDM4AO75164 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms