Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK2O60296 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms