Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA2O43921 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms