Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP9BO43861 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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