Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms