Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASKO14936 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASKO14936 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASKO14936 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASKO14936 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASKO14936 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASKO14936 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASKO14936 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASKO14936 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASKO14936 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASKO14936 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms