Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF6O14896 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF6O14896 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF6O14896 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF6O14896 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF6O14896 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF6O14896 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF6O14896 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF6O14896 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF6O14896 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF6O14896 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF6O14896 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF6O14896 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF6O14896 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF6O14896 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF6O14896 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF6O14896 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF6O14896 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF6O14896 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF6O14896 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF6O14896 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF6O14896 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF6O14896 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF6O14896 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF6O14896 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF6O14896 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF6O14896 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF6O14896 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF6O14896 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF6O14896 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF6O14896 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF6O14896 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF6O14896 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF6O14896 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF6O14896 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF6O14896 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF6O14896 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF6O14896 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF6O14896 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF6O14896 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF6O14896 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms