Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APAF1O14727 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APAF1O14727 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APAF1O14727 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APAF1O14727 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APAF1O14727 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APAF1O14727 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APAF1O14727 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APAF1O14727 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APAF1O14727 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APAF1O14727 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APAF1O14727 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APAF1O14727 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APAF1O14727 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APAF1O14727 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APAF1O14727 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APAF1O14727 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APAF1O14727 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
APAF1O14727 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APAF1O14727 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APAF1O14727 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APAF1O14727 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APAF1O14727 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APAF1O14727 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APAF1O14727 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APAF1O14727 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APAF1O14727 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APAF1O14727 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APAF1O14727 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APAF1O14727 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APAF1O14727 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APAF1O14727 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APAF1O14727 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APAF1O14727 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APAF1O14727 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APAF1O14727 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APAF1O14727 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APAF1O14727 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APAF1O14727 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APAF1O14727 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APAF1O14727 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APAF1O14727 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APAF1O14727 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
APAF1O14727 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
APAF1O14727 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APAF1O14727 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APAF1O14727 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APAF1O14727 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APAF1O14727 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APAF1O14727 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APAF1O14727 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APAF1O14727 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APAF1O14727 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APAF1O14727 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APAF1O14727 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APAF1O14727 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APAF1O14727 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms