Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLIM4O00461 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms