Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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