Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms