Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L12C9JPN9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms