Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF879B4DU55 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms