Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms