Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms