Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR11A4FU01 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR11A4FU01 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms