Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYL6

RPL17-C18orf32, Protein RPL17-C18orf32, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms