Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 PSEN1-205ENST00000406768 4062 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 MAP2-207ENST00000447185 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 FAM107A-201ENST00000360997 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ABCF2-202ENST00000287844 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 CNTRL-212ENST00000613863 2418 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ZNF888-202ENST00000638862 4195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 FLG-AS1-202ENST00000392688 2995 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC009108.3-201ENST00000602739 3515 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms