Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SERPINA9-202ENST00000337425 1755 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 OR2H2-202ENST00000641840 3061 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 IGKV3-15-201ENST00000390252 442 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RN7SL12P-201ENST00000473849 290 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC092868.1-201ENST00000557949 802 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC103740.1-204ENST00000557994 570 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MIR3689F-201ENST00000579617 66 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 KCTD2-206ENST00000581589 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC022784.6-204ENST00000520390 3442 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ACVR1-201ENST00000263640 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 VSIG1-202ENST00000415430 3236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 OAS2-207ENST00000620097 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RNA5SP185-201ENST00000390963 114 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RPL10P6-201ENST00000457497 318 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 NDUFS5P2-201ENST00000484004 306 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC136944.5-201ENST00000573021 151 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RN7SL376P-201ENST00000578594 264 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MIR6723-201ENST00000621981 89 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC079456.1-201ENST00000624010 480 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 NLRP9P1-201ENST00000540920 2655 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 BFAR-201ENST00000261658 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 TPD52-213ENST00000520527 2638 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 TTLL9-211ENST00000620043 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 SLC8A3-208ENST00000533541 3409 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 AC234782.3-201ENST00000461229 433 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CACNB1Q02641 MIR6745-201ENST00000612694 127 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms