Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RN7SL508P-201ENST00000464472 303 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ANKRD55-205ENST00000513241 626 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC138866.1-201ENST00000514522 497 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AL590560.1-203ENST00000544342 408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 OR4N1P-201ENST00000554847 949 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC069061.2-201ENST00000580686 480 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC093063.1-201ENST00000599317 363 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC138904.2-201ENST00000614412 107 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 PTPRR-203ENST00000378778 2632 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ATXN3-203ENST00000393287 6770 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 CD86-202ENST00000330540 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 OR14J1-203ENST00000641895 6443 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 BTK-201ENST00000308731 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 PIWIL4-201ENST00000299001 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MELK-201ENST00000298048 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 FHL1-203ENST00000370676 833 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 PKMP3-201ENST00000405497 715 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC010145.1-201ENST00000422415 516 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC092818.1-201ENST00000523411 639 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.124-201ENST00000610352 345 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RASSF5-209ENST00000636182 3427 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 TMC1-202ENST00000340019 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MAPK10-354ENST00000641823 2732 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SLC11A2-202ENST00000262052 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ABCF2P1-201ENST00000465687 1867 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MEF2C-222ENST00000514028 3393 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 CPEB1-AS1-202ENST00000618020 2994 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MEP1B-204ENST00000581447 2308 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SPATA19-201ENST00000299140 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RPSAP59-201ENST00000421048 890 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 CD59-206ENST00000445143 825 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 CCDC32-203ENST00000558113 576 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 TRPS1-208ENST00000519076 3329 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms