Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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