Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 ZNF320-201ENST00000391781 6074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RIPOR2-206ENST00000538035 5389 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC005884.2-201ENST00000593107 247 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RNA5SP287-201ENST00000516358 103 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC211486.5-201ENST00000616609 775 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 OAZ3-211ENST00000639906 708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms