Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZIC4-201ENST00000383075 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SKAP2-201ENST00000345317 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL133492.1-201ENST00000617854 3955 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLXNB2-213ENST00000610984 3443 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01410-201ENST00000424345 2877 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 THSD7A-202ENST00000423059 10663 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMX3-201ENST00000299608 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ST3GAL1-207ENST00000521180 6951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLRP1-201ENST00000262467 5131 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NTRK2-204ENST00000359847 6646 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD44-201ENST00000263398 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NTPCR-201ENST00000366627 1762 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAST4-203ENST00000403666 7586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCMH1-201ENST00000326197 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUMB-202ENST00000356296 3453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCAS3-202ENST00000407086 3496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NSUN7-202ENST00000381782 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 YTHDC2-201ENST00000161863 6316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBFOX1-202ENST00000340209 4099 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 EZH1-205ENST00000585893 2394 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MSRB3-212ENST00000614640 4270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CANT1-216ENST00000620915 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFYVE1-208ENST00000556143 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDR36-206ENST00000612402 6592 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB18-201ENST00000356940 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 DPP4-201ENST00000360534 3904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CORO2A-202ENST00000375077 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPA1-201ENST00000254719 4340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF594-202ENST00000575779 4335 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AKAP1-204ENST00000539273 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDR91-202ENST00000423565 4500 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 HPS5-203ENST00000396253 4725 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF574-204ENST00000600245 3598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACACB-201ENST00000338432 9360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZMIZ2-203ENST00000413916 3773 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NFASC-223ENST00000513543 3974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPM1-233ENST00000610733 3957 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 QARS-201ENST00000306125 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01193-201ENST00000553416 3401 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRP5L-208ENST00000610821 3602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF880-201ENST00000344085 496 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TOGARAM1-201ENST00000361462 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP5G1P8-201ENST00000416294 294 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL590648.3-201ENST00000446962 473 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC013480.1-201ENST00000451514 346 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC000067.1-201ENST00000452326 287 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM92-202ENST00000507382 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 VENTXP6-201ENST00000521543 314 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGHV7-27-201ENST00000522512 330 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 FXYD2-206ENST00000532119 562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006927.1-201ENST00000544818 498 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOS2P4-201ENST00000582696 205 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM95B1-204ENST00000586273 798 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007228.1-201ENST00000600036 142 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC091810.1-201ENST00000603131 325 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC126915.3-201ENST00000620111 208 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000769.3-201ENST00000622944 536 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC091953.1-201ENST00000624775 296 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TARS-216ENST00000627006 171 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1E-203ENST00000360108 6970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MSRB3-201ENST00000308259 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL25A1-209ENST00000622134 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACTN4P2-201ENST00000473049 1892 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms