Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF587B-203ENST00000594901 2118 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MORC1-201ENST00000232603 3764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NWD1-204ENST00000524140 7641 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SPIN1-201ENST00000375859 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DLST-202ENST00000334220 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EEA1-201ENST00000322349 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CUL2-203ENST00000374749 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 COL11A1-203ENST00000370096 7286 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-225ENST00000626620 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FNIP1-203ENST00000510461 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1683-206ENST00000600328 3819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LEP-201ENST00000308868 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NET1-201ENST00000355029 3402 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EFCAB12-204ENST00000505956 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GON4L-202ENST00000361040 5118 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3C2B-202ENST00000367187 7686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PDK2-216ENST00000614357 2493 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX10-203ENST00000526794 6707 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SVIL-201ENST00000355867 7586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RNPC3-208ENST00000533099 3641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 BBS7-201ENST00000264499 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL136295.5-201ENST00000558468 4798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AR-203ENST00000396044 10221 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKCQ-204ENST00000610727 3077 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 IREB2-208ENST00000560440 4396 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MPP2-221ENST00000625880 4668 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP10-201ENST00000418460 3516 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DIAPH3-205ENST00000400324 4804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPC3-201ENST00000264811 3675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF8-203ENST00000368074 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF286B-201ENST00000285274 5145 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB34-201ENST00000319119 6564 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GOSR2-215ENST00000638374 2683 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010422.6-201ENST00000593682 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NR3C2-207ENST00000511528 2967 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 IMPDH1P10-201ENST00000440965 1542 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SAXO2-201ENST00000339465 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 BTF3L4-201ENST00000313334 4703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LHX6-202ENST00000373754 3278 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3R4-201ENST00000356763 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 WFIKKN2-201ENST00000311378 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF417-201ENST00000312026 3597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.3 ms