Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL11A1-203ENST00000370096 7286 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 IP6K1-209ENST00000613416 4806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF664-201ENST00000337815 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073869.1-202ENST00000438378 3785 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 WIPF2-201ENST00000323571 7474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRIF1-201ENST00000369763 3475 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF599-202ENST00000587354 3476 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIOBP-204ENST00000406386 10129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 IARS2P1-201ENST00000508226 3173 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 POP1-202ENST00000401707 4719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLP1-223ENST00000621218 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLHL24-205ENST00000454652 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 STX16-204ENST00000359617 4273 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TEX2-201ENST00000258991 5232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 BACH2-210ENST00000537989 9108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SFTPB-201ENST00000393822 3666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZDHHC15-203ENST00000541184 6012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCDHGB6-202ENST00000616430 4601 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYP2B6-201ENST00000324071 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LASP1-203ENST00000433206 4023 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFT122-203ENST00000348417 3877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RSPH3-202ENST00000367069 6561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 EVL-203ENST00000544450 3704 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AFF1-202ENST00000395146 9285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 BDP1-201ENST00000358731 11073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SERPINA10-202ENST00000393096 2451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ESR1-207ENST00000440973 6466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALDH7A1P1-201ENST00000510973 1533 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF75D-201ENST00000370764 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 BOC-201ENST00000273395 4276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 BOC-202ENST00000355385 4278 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEFF2-202ENST00000392314 2842 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNOT3-202ENST00000358389 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCL2L13-216ENST00000616863 4761 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEMA4G-205ENST00000517724 2675 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SRP72-201ENST00000342756 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRPF3-212ENST00000534694 4628 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZMIZ2-205ENST00000433667 3800 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASAL1-204ENST00000546530 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AASS-203ENST00000417368 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 C11orf57-201ENST00000280352 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1C-201ENST00000327702 6616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD44-206ENST00000415148 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 STARD4-212ENST00000512160 3500 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PROX2-201ENST00000556084 3359 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPATCH2-201ENST00000366934 3218 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF587-201ENST00000339656 6882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 VASH2-206ENST00000366968 4224 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF587-202ENST00000419854 5731 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMGB3-201ENST00000325307 3560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPRTN-204ENST00000391858 3559 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP2B3-205ENST00000393842 4064 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1E-206ENST00000367573 7067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZBBX-203ENST00000392766 3250 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RYR1-201ENST00000355481 15377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PNPLA8-201ENST00000257694 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 COMMD9-201ENST00000263401 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP231-201ENST00000363281 277 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 APOM-203ENST00000375920 709 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC018638.1-201ENST00000414464 330 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL049758.1-201ENST00000423154 397 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z83839.1-201ENST00000423412 630 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.4 ms