Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 COL12A1-207ENST00000483888 9637 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 FAT4-201ENST00000335110 9669 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 MYOM1-202ENST00000356443 5847 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 MYO15A-201ENST00000205890 11863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 MYO15A-217ENST00000615845 11860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 TENM2-207ENST00000520394 8034 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AC008467.1-201ENST00000512693 5471 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 KIAA0319-206ENST00000616673 5315 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF791-202ENST00000446165 6412 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 KCNMA1-248ENST00000638991 11990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 EPHB2-204ENST00000400191 10816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 PTPRB-204ENST00000538708 5839 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 GAS7-201ENST00000323816 8033 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 FP325330.3-201ENST00000623760 9537 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 C18orf32-203ENST00000613385 5395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms