Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 VMA21-201ENST00000330374 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRHP20396 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 LINC00683-202ENST00000579781 3510 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 RECQL-203ENST00000421138 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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TRHP20396 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TRHP20396 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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TRHP20396 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TRHP20396 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TRHP20396 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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TRHP20396 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRHP20396 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TRHP20396 C9orf72-206ENST00000619707 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TRHP20396 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TRHP20396 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TRHP20396 PTPRT-211ENST00000618610 3230 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 FAM122C-211ENST00000623326 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 LPL-201ENST00000311322 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 AC068481.1-201ENST00000415520 530 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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