Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms