Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD2APQ9Y5K6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD2APQ9Y5K6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD2APQ9Y5K6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD2APQ9Y5K6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD2APQ9Y5K6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD2APQ9Y5K6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD2APQ9Y5K6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD2APQ9Y5K6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD2APQ9Y5K6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD2APQ9Y5K6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms