Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms