Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHDC2Q9Y2U9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms