Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms