Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms