Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
L1RE1Q9UN81 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms