Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRQQ9UMZ3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms