Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms