Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms