Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms