Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPN3Q9UHW5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPN3Q9UHW5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms