Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACFD1Q9UGQ2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACFD1Q9UGQ2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms