Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms