Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms