Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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