Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ORC3Q9UBD5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms