Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MBD2Q9UBB5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms